近日，我校生命科学学院代琦副教授团队在功能基因组岛研究方向取得重要进展，在生物信息学Top期刊《Briefings in Bioinformatics》上发表题为“MTGIpick allows robust identification of genomic islands from a single genome”的研究论文，该刊影响因子8.399。

基因组岛是具有横向起源迹象的基因簇, 有多种移动元件特征，包含移动基因，可以在不同种菌株间水平转移。基因组岛与多种复杂的生物功能相关，其研究不仅有助于微生物的致病作用与抗生素抗性研究，还对共生微生物的共生性及外源性化合物的降解具有重要作用。目前该研究的瓶颈在于如何利用高通量的基因组数据，准确地识别基因组岛位置，降低比较基因组方法中存在的假阴性问题。本论文首次提取基于多尺度统计检验的基因组岛识别算法，将基因组岛的大尺度定位与小尺度分割算法相结合，实现基因组岛的准确定位预测。通过构建本地基因组数据与在线并行算法平台，系统研究不同物种之间的基因组岛迁移，分析其结构特征与迁移机制，实现基于基因组岛的系统发育分析，构建具有特定生物学功能的工程菌株。本论文是与美国德州大学系统生物学研究中心负责人、长江学者、清华大学兼职教授Michael. Zhang合作研究成果，也受到NIH项目支持。

该成果已开发不同平台的软件，搭建了在线服务平台，http://bioinfo.zstu.edu.cn/MTGI/index.html，欢迎大家使用交流！

           供稿：生命科学学院  生物制药与生物信息学学科组

附文章链接

http://bib.oxfordjournals.org/content/early/2016/12/25/bib.bbw118.abstract