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生命科学学院在phasiRNA的识别上取得新进展

发表于:2014-09-24  浏览人数:

Phased small RNA是新近发现的一类植物小分子RNA,包括21-nt24-nt两种形式。有研究证实,反式作用干扰小RNAtasiRNAs),是由22-nt miRNA介导产生的一类长度为21 nt的特殊 phased siRNA,在植物体内的生物合成过程如图1所示。

国内外对phasiRNA的研究刚刚起步,金伟波等人开发的PhaseTank工具,是目前国内外第一款专门用于phasiRNA的识别及功能预测,PhaseTank返回的结果简洁易读,信息量丰富,能够有效指导后续利用生物学实验鉴定及功能分析。该研究结果已于2014922日在线发表于生物信息学科国际顶级Bioinformatics, doi: 10.1093/bioinformatics/btu628,金伟波实验室硕士研究生郭清利为该论文的第一作者。该项研究受到国家自然科学基金和浙江省重中之重项目等资助。

1. Pathways for the Biogenesis of PhasiRNAs Modeled on Arabidopsis [Plant Cell, 2013, 25: 2400–2415].

作者与来源:生物信息学科组 金伟波